Departamentin fəaliyyətinin əsas məqsədi müasir standartlara uyğun informasiya sistemlərinin yaradılmasını, dəstəklənməsini və onların digər sistemlərlə inteqrasiyasının təşkil edilməsidir.

 Departamentin əsas funksiyaları:

• Müasir tələblərə cavab verən informasiya sistemlərinin yaradılması, daim inkişaf etdirilməsi və bu sahədə beynəlxalq təcrübənin öyrənilməsi;
• İnformasiya sistemlərinin etibarlı və davamlı fəaliyyətinin təmin edilməsi;
• Avtomatlaşdırmadan kənar qalan sahələrin müəyyən edilməsi, bununla əlaqədar informasiya texnologiyalarına dair tələblərin və texniki tapşırıqların hazırlanması və avtomatlaşdırma prosesinə cəlb edilməsi; 
• Proqramlaşdırılacaq məsələlərin alqoritmlərinin və proqram təminatlarının işlənib hazırlanması;
• İnformasiya sistemlərinin müasir standartlara uyğun olaraq digər sistemlərə inteqrasiyasının təşkil edilməsi;
• İnformasiya sistemlərinin fəaliyyətinin təmin edilməsi ilə əlaqədar Universitetin normativ-metodoloji bazasının hazırlanması və daim təkmilləşdirilməsi;
• İnformasiya texnologiyaları məsələlərinə dair departamentə daxil olan müraciətlərə baxılması, məktub və sorğulara cavabların hazırlanması.