К подготовке магистров в Азербайджанском государственном университете нефти и промышленности начали с 1997/1998 учебного года в соответствии с «Положением о магистерской подготовке (магистратуре) в системе многоуровневого высшего образования Азербайджанской Республики», утвержденным постановлением №15 Кабинета министров Азербайджанской Республики от 13 февраля, 1997 года.

 

На уровне магистратуры АГУНП подготовка магистров осуществляется по очной форме по специальностям и специализациям на 7 факультетах и по международным программам в рамках «Подготовка магистров по управлению бизнесом и совершенствование профессорско-преподавательского состава» (MBA) и «Окружающая среда и нефтяная промышленность» (TEMPUS).